从基督教学术视角来看，《古兰经》中关于耶稣（尔撒·麦西哈）的叙事，代表了伊斯兰文本中最核心的神学战场。
历史批判研究揭示，《古兰经》中的耶稣是一个第二世纪的幻影说综合体，与《新约》中目击门徒使徒的见证有着根本性的断裂。
虽然《古兰经》保留了耶稣的童贞女诞生和神迹，以维持其圣经权威的表面形式，但它系统地剥夺了耶稣的神圣身份、代赎性救赎以及历史性的复活。
通过将“万王之王”降级为穆罕默德的凡人先驱，《古兰经》试图瓦解宇宙救赎的核心。
原始的启示文献记载，天使加百列向童贞女马利亚宣告，她将藉着圣灵的大能 miraculously（奇迹般）地怀孕生下弥赛亚。
路加福音 1:34-35：
马利亚对天使说：“我没有出嫁，怎么有这事呢？”天使回答说：“圣灵要临到你身上，至高者的能力要荫庇你，因此所要生的圣者必称为神的儿子。”
《古兰经》后来的阿拉伯语文本反映了这一事件，保持了马利亚的童贞以及天使关于奇迹般儿子的宣告。
《古兰经》第19章 19-20节：
他说：“我仅仅是你主的使者，来把一位纯洁的男婴报喜于你。”她（麦尔彦）说：“我无男人 touching（接触/碰触），怎能有儿子呢？”
耶稣的公开事工得到了大量公共神迹的验证，包括医治盲人、洁净麻风病人和使死人复活。
马太福音 11:5：
瞎子看见，瘸子行走，长大痳疯的得洁净，聋子听见，死人复活，穷人有福音传给他们。
《古兰经》承认耶稣被赋予了超自然的迹象，明确提到了医治盲人、麻风病人以及使死人复活。
《古兰经》第3章 49节：
“……我确已带着你们的主的一个证据来见你们，我将用泥造一个鸟的形状，吹气在里面，它就奉真主的命令变成飞鸟；我又治患有盲症的和患麻疯病的，我又使死人复活，奉真主之命……”
基督教信仰的基础信条是：耶稣基督不仅仅是一个男人，而是永恒、非受造的上帝的儿子，道成肉身的上帝。
马太福音 16:16：
西门彼得回答说：“你是基督，是永生神的儿子。”约翰福音 10:30：
我与父原为一。
《古兰经》猛烈攻击基督的神性，诅咒那些称耶稣为上帝之子的人，并将他严格限定为受造的人类使者。
《古兰经》9:30：
……基督徒说：“麦西哈（基督）是真主的儿子。”这是他们口中所言；他们仿效了不信道者以前的言论。愿真主毁灭他们；他们是如何被迷误的？《古兰经》5:72：
确实否认信道了，那些说：“真主就是麦西哈（基督），尔撒（耶稣）的母亲麦尔彦（玛丽亚）之子”的人……
耶稣的十字架受难是古代历史中无可争议的事实，也是救赎不可妥协的基石，基督在此作为替代性的祭物，为人类的罪流出了宝血。
彼得前书 2:24：
他亲自担当了我们的罪，用自己的身体挂在木头上，使我们向罪而死，向义而生；因他受的鞭伤，你们便得了医治。
在令人震惊的历史和神学修正中，《古兰经》否认耶稣被钉死在十字架上，声称那只是一场视觉错觉，另有他人秘密地替代了他。
《古兰经》4:157：
因为他们说：“我们确实杀死了麦西哈（基督），尔撒（耶稣），麦尔彦（玛丽亚）之子，真主的使者。”他们并没有杀死他，也没有把他钉死在十字架上，只是他们看来是如此……
正典福音书记载，耶稣的公开事工和神迹严格始于他的洗礼，他的第一个正式神迹发生在迦拿的婚宴上。
约翰福音 2:11：
这是耶稣所行的头一件神迹，是在加利利的迦拿行的，显出他的荣耀来；他的门徒就信了他。
《古兰经》引入了非历史性、传奇式的童年神迹，描绘耶稣作为婴儿在摇篮中流利说话以辩护马利亚，并动态地吹气使泥鸟获得生命。
《古兰经》19:30：
[尔撒]说：“我确是真主的仆人。他赐给我经典，使我作先知。”
《古兰经》5:110：
……当你用我的许可，从泥土中雕塑出鸟的形态，然后你向其中吹气，它便变成真主许可的一只鸟……
重写耶稣生平的主要动机，是为了消除福音书的必要性。
如果耶稣是神的独生子，在十字架上死而复活，那么人类就得到了拯救，旧约之约已得成全，此后出现的任何宗教都完全过时了。
通过抹除基督的十字架受难与神性，伊斯兰教有效地消解了十字架的意义，将人类的救赎从对一位神圣救赎主的需求，简化为对一本律法书（沙里亚）的需要。
这使得穆罕默德得以将自己呈现为一位终极且更优越的先知，他完成了一脉相承的、纯属人类的先辈谱系。
《古兰经》中耶稣叙事的激进转变并非来自新的神圣启示，而是直接源于接触了晚期、异端且正典之外的文献，这些文献在新约正典确立数个世纪后才渗入阿拉伯半岛。
《多马童年假福音书》：
关于耶稣用泥土捏鸟并吹气使其成活的奇异叙事（《古兰经》5:110）直接摘录自这部2世纪诺斯替文本的第2章。
《叙利亚-阿拉伯童年假福音书》：
婴儿耶稣从摇篮中说话的事迹（《古兰经》19:30）逐字取自这部晚期、异端叙利亚/阿拉伯伪经的第1章。
诺斯替幻影说与替代说：
声称耶稣实际上并未被钉十字架，只是“被弄得像他一样”（《古兰经》4:157）的主张，直接照搬自2世纪诺斯替幻影说（Docetism）。
像巴西利得（Basilides）和《伟大塞斯的第二卷书》作者等异端分子明确教导：耶稣通过将外貌转移到另一个人身上（如西门的门徒 Simon of Cyrene），从而规避了十字架上的身体苦难。穆罕默德误将这些边缘异端的童话故事当作权威历史。
《古兰经》对三位一体激烈的论战表明，其作者并不了解正统的基督教神学，而是将其与伊斯兰教兴起前阿拉伯异教的本土多神结构混为一谈。
虚假的三元神：
《古兰经》明确将基督教的三位一体定义为三个独立的神明：天父上帝、圣母马利亚和圣子耶稣。
第5章116节（筵席章）：
当真主说：“尔撒啊！麦尔彦之子啊！你曾对众人说过‘你们当舍我和我母亲，而崇拜二神吗？’”吗？
异教的重叠误解：
这种严重的误解源于两个具体的7世纪现实背景。
伊斯兰兴起前的阿拉伯异教深深建立在神圣三元神体系之上——具体来说，有一位最高主神（真主/安拉），他育有 regional 的女神女儿们（拉特、乌扎和曼阿特）。由于阿拉伯语中将“灵”（Rucha）一词用作阴性名词，像穆罕默德这样的口头观察者便假设基督教的“圣父、圣子与圣灵”只是另一种类似异教的生物学三元结构，由父亲、母亲（马利亚）和孩子（耶稣）组成。
《古兰经》中对耶稣的描述是一幅透明的7世纪神学伪造图景。通过剥夺历史弥赛亚的神性之子身份，为了迎合晚期教义而抹除十字架受难的历史事实，并在文本中充斥异端的诺斯底主义寓言以及对三位一体近乎异教的误解，《古兰经》暴露了其晚近且人为编纂的本质。
这一分析揭示了伊斯兰教的致命缺陷：它是一个次生的、还原论的运动，试图借用真正弥赛亚的历史威望，同时积极拆毁那保障了世界救赎的十字架与空坟墓。