1. 三位一体误解：
《古兰经》4:116 错误地将三位一体定义为父、子、马利亚，暴露了其地方性、7世纪的人类误解，而非神圣的全知。
2. 解剖学时代错误：
《古兰经》80:5-7 直接编入了公元前5世纪希波克拉底关于体液产生的过时医学错误，从而驳斥了科学准确性。
3. "瓦贾达"问题：
《古兰经》18:86 使用字面散文（wajada）描述太阳物理上沉入泥泞的泉水中。
指责（精神和智力上的）愚蠢被用来论证穆罕默德并非受全知上帝的引导，而是一个容易犯历史错误、陷入地方迷信和人际操纵的世俗领袖。
证明他缺乏灵性洞察力最有力的证据是他起初背诵赞美三位异教女神（al-Lat, al-Uzza, 和 Manat）的经文，后来却声称撒旦欺骗了他的事件。论战者认为，真正的先知必须能够区分造物主的声音与敌对者的声音。如果他曾被诱骗去传讲多神教，那么整部《古兰经》的可信度就受到了损害。
《古兰经》4:116 被用来论证穆罕默德认为基督徒将马利亚视为与上帝和耶稣并列的神祇来崇拜。
在《古兰经》4:116中，真主质问耶稣！基督教的主要分支：天主教、东正教或新教；从未将马利亚作为神格的一部分来崇拜。
穆斯林护教士会声称这节经文并未定义三位一体，而是谴责了科尔里底安派（据称崇拜马利亚）这个异端派别，或者只是斥责基督徒过度尊崇她。
然而，《古兰经》 nowhere 定义了真正的基督教三位一体（父、子、圣灵）。相反，每当它命令基督徒停止说“三”（《古兰经》4:171，《古兰经》5:73）时，语境始终指向真主、耶稣和马利亚。
宇宙的全知作者会知道标准基督教正统与边缘异端团体之间的区别。
在《古兰经》第9章第61节 [https://quran.com/9?startingVerse=61] 中，古兰经公开承认穆罕默德的同代人认为他极其轻信且容易被操控：
其中有为先知所毁谤的人，他们说：“他是一个听风就是雨的人（udhun）。”
“听风就是雨”这一术语是当时的习语，意指某人完全相信他们所听到的一切，而不加核实。
虽然这节经文试图将其美化为一种积极的特质（“这是你的福祉之耳”），但它无意中证实了他的同代人视他为极易受暗示、容易被最后引起他注意的人所操纵。
引用 第86章第5-7节 [https://quran.com/86?startingVerse=5] 是为了表明一种错误的观点，即精液是从“脊梁骨和肋骨之间”发出的。
现代伊斯兰资源试图在这里进行“科学奇迹”式的辩解，声称这节经文指的是睾丸在肾脏附近发育的胚胎阶段（L1-L2脊椎水平）。
但文本明确谈论的是在生殖过程中从完全成形的成年人身体中排出的液体（“让人观察他是被创造的……”）。
医学科学早已确立，精液由位于骨盆区域的睾丸和精囊产生——远离胸骨肋骨或上脊柱。这节经文仅仅反映了古代错误的希腊医学理论（如希波克拉底的理论），这些理论已经渗透到前伊斯兰时代的近东地区。
引用 第18章第86节 [https://quran.com/18?startingVerse=86] 是关于太阳似乎落入“黑泥之泉”的叙述。
标准的劝归（达瓦）回应是，这是一种现象学的视角。意思是，从祖尔·卡纳因（Dhul-Qarnayn）的视角来看，它只是看起来落入泥泞的泉水中（就像看着太阳在海平面上落下）。
文本使用了字面的阿拉伯语单词“发现”（wajada），而不是“对他来说好像”。此外，早期的伊斯兰传统和圣门弟子（如伊本·阿巴斯）的诗歌表明，他们采取了字面观点，即太阳实际上 plunge 进了一汪温暖的泥泞泉水中。
《穆斯林圣训实录》1453 记载了一项离奇的裁决，穆罕默德指示名叫萨拉赫的女子去给一个叫萨利姆的成年男子哺乳，使他合法地成为她的“乳子”，从而可以无陪同地进入她的家中：
你给他哺乳吧，这样他在婚姻上对你就成为非法的（禁止通婚），艾布·胡扎法脸上的厌恶神情就会消失。
这项裁决并没有确立一个永恒且庄严的道德规范，而是引入了一种令人极度尴尬的做法，以绕过基本的伊斯兰隐私法规（希贾布/面纱）。这显现出一个人类领袖绝望且笨拙的临场发挥，而非一位全智上帝那完美无瑕的法律。
来自上帝的真正启示带来的是清晰、理性上的严谨以及深厚的属灵智慧。这些经文所描绘的形象恰恰相反：显示了一个经常力不从心的人。
穆罕默德是一个缺乏圣灵所应许的“健全理智”的人。他无法描述基本的人类解剖学，受制于原始的宇宙观，并且容易被同伙操控。
这些结构性缺陷表明，《古兰经》并非源自全知者的宝座；它反映的是公元7世纪阿拉伯有限且前伊斯兰的世界观。