虽然《古兰经》在宏观上涵盖了出埃及记的故事轮廓，但它引入了一些与早期圣经记载以及考古发现相冲突的具体细节。
以下是对《古兰经》中有关法老的主要历史和内部错误的关键评估。
最显著的历史谬误之一，是将哈曼（Haman）描述为法老的左右手和首席建筑师（参见 古兰经 28:6、28:38、40:36）。
这与早期圣经的记载相冲突。在《以斯帖记》中，哈曼是亚哈随鲁王（薛西斯一世）手下的波斯官员，其生活时代大约比出埃及事件晚了1,000年。
《古兰经》将波斯的名字/人物置于新王国时期的埃及背景中，这是错误的。虽然一些穆斯林护教者辩称“哈曼”可能是阿蒙祭司的头衔，但没有任何考古证据表明在第十八或第十九王朝期间，有一位名叫哈曼或拥有此头衔的埃及官员服务于法老。
在 古兰经 28:38 和 40:36-37 中，法老命令哈曼用烧制的砖块建造一座高塔，以便“触达摩西的上帝”。
这段叙事似乎混淆了出埃及记中的法老与 创世记 11 中巴别塔的记载。
古埃及人在大型建筑中并不使用烧制的砖块；他们在民居中使用晒干泥砖，而在神庙和金字塔中使用切割的石块。“点燃火来烧砖”（古兰经 28:38）的命令反映的是美索不达米亚的建筑实践，而非埃及的。
在 古兰经 7:124 和 20:71 中，法老威胁他的术士（他们在目睹摩西的神迹后皈依），说要“将你们钉在棕榈树的树干上”。
这是一个重大的历史谬误，因为钉十字架是罗马和波斯人的处决方式。在法老时代（约公元前 1500–1200 年），埃及并不存在这种刑罚。
圣经中提到的是“悬挂”（例如创世记中塔富尼的父亲被悬挂的情况），但将受害者绑在或钉在十字架上或树上进行公开处决的具体做法，是后来才出现的历史现象。
《古兰经》将拯救摩西的女子认定为法老的妻子，即阿西雅（参见28:9）。
这与前文《圣经》记载出埃及记 2:5-10中明确说明是法老的女儿发现并收养摩西的叙述相矛盾。
通过改变人物关系，《古兰经》消除了《圣经》文本中的反讽意味：下令杀害希伯来男婴的法老家，被迫付钱给希伯来母亲（约基别）以哺乳她的儿子，而这一切都在公主的保护之下进行。
10:90-92节声称，当法老溺水时，他承认信仰以色列的上帝。《古兰经》称，真主决定保存他的肉身作为“给你们后世者的一个迹象”。
这（再次）与《圣经》记载（出埃及记 14）相矛盾，在《圣经》中，法老及其全军被毁灭，并未提及任何临终皈依的情节。
此外，尽管发现了多位法老的木乃伊（如拉美西斯二世或梅伦普塔赫），但没有任何考古证据证明有一位法老溺亡并被特别保存为《古兰经》审判的“迹象”。
这些差异表明，《古兰经》的作者可能是在借鉴拉比民间传说、叙利亚传说和口述传统，而非基于主要的历史资料或神圣源头。将巴别塔（创世记 11）与出埃及记（出埃及记 1-4）以及《以斯帖记》的情节混为一谈，显示出将近一千年的时间线混乱。