穆斯林关于《古兰经》保存的常见叙事通常断言，《古兰经》从穆罕默德口中逐字、逐字母、逐音地原封不动地被保存下来，没有任何文本差异。然而，历史伊斯兰来源、早期圣训集以及古典《古兰经》注释（tafsir）呈现了一个复杂得多的现实。
多种正定读音（Qira'at）的存在、非正定型变体以及手稿差异表明，《古兰经》经历了独特的文本传承与正典化历史。当结合古典伊斯兰学术成果来看，认为这些差异仅仅是次要方言差别的说法是站不住脚的。此外，将《古兰经》的文本传承与新约的进行比较，突显了现代辩诉主张与历史现实之间的巨大差异。
面对《古兰经》变异的常见回应是，这些变异代表了真主赐予的不同地区方言（ahruf），以简化各阿拉伯部落的诵读。然而，正定圣训显示，来自同一部落且使用完全相同方言的圣门弟子之间也存在差异。
在《布哈里圣训实录》中，欧麦尔·本·哈塔卜记录了他因希沙姆·本·海凯姆诵读《古兰经》第25章（区分章/法尔坎章）的方式与自己不同而与之发生身体冲突：
《布哈里圣训实录》2419：
我听到希沙姆·本·哈基姆以与我不同的方式诵读《法尔坎章》……我差点与他争吵……我将他的衣服绑在他的脖子上并抓住了他……然后把他带到真主的使者面前。
欧麦尔和希沙姆都属于古莱什部落。古典学者伊本·贾扎里明确指出，这一分歧发生在两位共享同一种语言且属于同一部落的个人之间，表明这些变体超出了单纯的地区发音差异（《十大读音考释》，第1卷，第24页）。
正定型Qira'at内部的变体不仅仅是元音或风格上的不同，它们还改变了法律裁决、历史细节和神学含义。即使有人主张奥斯曼将文本标准化为单一的书写骨架（rasm）以消除早期圣门弟子的分歧，但至今仍保留的正定Qira'at中仍然存在重大的、非方言性的在意义、语法和法律裁决方面的差异。
Bridges基金会主任、《十种经文读音》Bridges译本的主要翻译者法德尔·索利曼博士（Dr. Fadel Soliman）在其翻译工作中指出，在所有正统读音中记录的文本异文中，约有30%改变了特定单词或从句的含义，而不仅仅是元音变体或发音上的差异。
如塔巴里（Al-Tabari）等古典学者并不将所有异文视为同等和谐或神圣的。相反，他们通过学术偏好（tarjih）评定某一异文优于其他异文，或在语法和语境上更真实；有时甚至运用理性标准来拒绝某些异文的语境有效性：
第1章第4节（Malik与Melik之辨）：塔巴里指出，读音Melik（“国王”）优于Malik（“所有者/主人”），且“更真实”（ahaqq），因为每一位国王都是所有者，但并非每一位所有者都是国王（《塔巴里经注》，第1章第4节）。
第3章第146节（Qutila与Qatala之辨）：在评估经文是意为“许多先知被杀（qutila）”还是“与虔诚之人一同战斗（qatala）”时，塔巴里记录了这样的论点：读音“被杀”与随后的短语“他们并未丧志”产生逻辑矛盾，因此评论家们为了支持另一种读音而拒绝了该异文的语境有效性（《塔巴里经注》，第3章第146节）。
当今最常见的标准读音——哈菲斯传述阿西姆（Hafs 'an 'Asim）传统——并非在穆罕默德时代确立。哈菲斯于伊斯兰历180年（公元796年）去世，距穆罕默德逝世近150年。
七位主要诵读者的选定由伊本·穆贾希德（Ibn Mujahid）在10世纪（伊斯兰历322年）确立，距穆罕默德逝世已逾三个世纪。另外三组读音由伊本·杰扎里（Ibn al-Jazari）在15世纪（伊斯兰历833年）被正典化，而现代哈菲斯文本则通过1924年的开罗皇家版得到了广泛标准化。
在奥斯曼收集并标准化之前，受穆罕默德委托的关键圣门弟子持有的抄本中，Surah（章节）数量有所不同：
伊本·姆苏欧德（Ibn Mas'ud），据《布哈里圣训实录》3758所述，穆罕默德明确指示信徒向此人学习《古兰经》，但他在其抄本中省略了第1章《开端章》（Al-Fatiha）以及《求护章》（Surahs 113 and 114, Al-Mu'awwidhatayn）（《布哈里圣训实录注疏》Fath al-Bari，伊本·哈贾尔编，第8卷，第742页）。
乌拜伊·本·凯卜（Ubayy ibn Ka'b）在其抄本中包含了两个在标准114章抄本中未见的额外章节：《Al-Hafd》和《Al-Khal'》（《古兰经学科精义》Itqan fi 'Ulum al-Qur'an，苏尤蒂著）。
新约被认为通过历史抄本传承，其中存在人工誊抄错误，但原始文本仍可复原。相比之下，流行护教论声称《古兰经》以一字不差、一字不落的方式得到保存，没有任何差异。
少于1%的新约变体影响文本含义（根据丹尼尔·华莱士博士的观点，具有高可靠性的变体占比不足0.1%）。对于《古兰经》，法德尔·索利曼博士等学者估计，在正统读音（Qira'at）中，约有30%的文本变体会改变特定词语或从句的含义。
文本学者——包括布鲁斯·梅茨格等保守派学者和巴特·埃尔曼等怀疑论批评家——一致认为，没有任何基本的基督教教义依赖于有争议的文本变体（《误引耶稣》，第252页）。相反，《古兰经》的正统变体会改变文本中的语法结构、法律裁决和叙事行为。
早期教父公开记录并评估了抄本变体。例如，爱任纽（约公元180年）评估了《启示录》13:18中616与666的变体，引用早期见证和抄本来确认666（《反异端》，卷五，第30章）。早期伊斯兰学者也辩论哪些读音更优或逻辑上不可能，尽管后来的流行叙事转向主张口传的完美一致性。
历史记录表明，《古兰经》的文本历史涉及独特的读音、竞争性的同伴抄本以及跨越数个世纪的多阶段正典化过程。古典伊斯兰学者如塔巴里和伊本·贾扎里公开参与了这些变体的讨论，承认了超越简单方言变化的差异。当根据历史原始资料进行评估时，关于单一、无变化文本的断言并不Supported于用于记录《古兰经》传承的传统本身。